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만성 골수성 백혈병의 진정한 관해는 필라델피아 염색체 양성 세포가 모두 없어지고 세포유전학적으로 정상적인 세포로 대치되어야만 됩니다. 이러한 상태는 일반적인 항암제 치료로는 매우 어려우며 조혈모세포 이식만이 유일한 치료법입니다. 특히 만성기에 조혈모세포 이식을 하여야 재발의 위험성이 낮으므로 조혈모세포이식의 시기가 매우 중요합니다.

이에 따라 만성기 환자에 대한 일차적인 치료목적은 백혈구 증가와 기관의 종대로 인한 증상을 호전시키는 것이며 가속기나 모세포기로 진행된 경우에는 만성기로의 회복에 치료 목적이 있습니다.

여러 가지 이유로 동종 조혈 모세포 이식을 시행하지 못할 경우 대체치료로 인터페론 치료를 시행합니다. 처음 만성기로 진단받은 직후에는 주로 경구용 항암제로서 백혈구 수를 낮추면서 비장종대 등의 임상 증상을 호전시키게 됩니다.

인터페론 치료는 경구용 항암제로 치료한 환자보다 생존율에 있어 좋은 치료 성적을 보이고 있습니다. 필라델피아 염색체 양성 세포의 수가 감소하는 반응을 보여 세포 관해율이 높아지며 혈액학적 관해율이 호전됩니다. 또한 만성기에서 가속기로 진행되는 것을 늦출 수 있어 생존 기간을 연장시킵니다.

인테페론 치료의 부작용은 감기 같은 증상이 가장 많고, 이는 보조적인 치료로 쉽게 조절되며, 심한 경우에는 혈소판 감소증, 갑상선 기능 감소증 및 용혈성 빈혈이 생길 수 있습니다. 이외에 비대해진 비장을 절제하는 경우도 있는데, 이는 비장 기능 항진증이나 비장 종대로 인한 고통스러운 상황에 있을 경우 시행합니다.