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유잉육종은 항암제와 방사선치료에 민감하기 때문에 수술보다는 항암제나 방사선치료가 원칙입니다. 주로 사용하는 항암제는 vincristine, cyclophosphamide, adriamycin, actinomycin-D, ifosfamide, etoposide 등으로서 이들을 병합하여 사용합니다. 고용량 방사선치료로 치료 성적을 높였으나 뼈의 성장 장애, 연부조직의 섬유화 또는 이차암 발생의 가능성을 고려해야 합니다.

근래에는 수술전 항암제 치료의 발달로 사지구제술을 시도할 수도 있습니다. 항암제에 잘 반응하지 않고 큰 경우, 늑골이나 비골 상단부 등 제거해도 일상 생활에 영향이 없는 뼈에 발생한 유잉육종은 수술을 시행하고 항암제를 사용합니다.

수술이나 방사선치료만으로는 완치가 10% 내외였는데 근래에 항암제치료와 방사선치료로서 전이가 없다면 환자의 60%가 완치됩니다. 그러나 진단시 전이가 있다든지 팔다리뼈가 아닌 몸통의 뼈에 생긴 경우는 이 보다 예후가 많이 나쁩니다.